Protein–RNA interactions for Protein: O35427

Crcp, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrcpO35427 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CrcpO35427 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CrcpO35427 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CrcpO35427 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CrcpO35427 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CrcpO35427 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CrcpO35427 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CrcpO35427 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CrcpO35427 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CrcpO35427 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CrcpO35427 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CrcpO35427 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrcpO35427 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrcpO35427 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrcpO35427 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms