Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
H2-ObO35424 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
H2-ObO35424 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-ObO35424 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms