Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd2O35392 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms