Protein–RNA interactions for Protein: O35386

Phyh, Phytanoyl-CoA dioxygenase, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhyhO35386 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PhyhO35386 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PhyhO35386 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PhyhO35386 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PhyhO35386 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PhyhO35386 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PhyhO35386 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PhyhO35386 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PhyhO35386 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PhyhO35386 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
PhyhO35386 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PhyhO35386 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PhyhO35386 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PhyhO35386 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PhyhO35386 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PhyhO35386 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PhyhO35386 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PhyhO35386 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PhyhO35386 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PhyhO35386 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PhyhO35386 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms