Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppef2O35385 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppef2O35385 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ppef2O35385 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppef2O35385 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppef2O35385 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppef2O35385 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppef2O35385 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppef2O35385 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppef2O35385 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppef2O35385 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppef2O35385 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppef2O35385 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppef2O35385 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppef2O35385 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppef2O35385 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppef2O35385 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppef2O35385 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppef2O35385 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppef2O35385 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppef2O35385 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppef2O35385 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppef2O35385 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppef2O35385 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppef2O35385 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppef2O35385 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppef2O35385 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppef2O35385 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppef2O35385 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppef2O35385 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppef2O35385 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppef2O35385 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppef2O35385 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppef2O35385 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppef2O35385 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppef2O35385 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppef2O35385 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppef2O35385 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppef2O35385 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppef2O35385 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppef2O35385 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppef2O35385 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppef2O35385 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppef2O35385 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppef2O35385 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ppef2O35385 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppef2O35385 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ppef2O35385 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppef2O35385 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ppef2O35385 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppef2O35385 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppef2O35385 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppef2O35385 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppef2O35385 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppef2O35385 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppef2O35385 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppef2O35385 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppef2O35385 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppef2O35385 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms