Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf11aO35305 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf11aO35305 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms