Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pkd2O35245 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pkd2O35245 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms