Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Kcns1O35173 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Kcns1O35173 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Kcns1O35173 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Kcns1O35173 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcns1O35173 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms