Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ncoa3O09000 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ncoa3O09000 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ncoa3O09000 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ncoa3O09000 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ncoa3O09000 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ncoa3O09000 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ncoa3O09000 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ncoa3O09000 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ncoa3O09000 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ncoa3O09000 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ncoa3O09000 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ncoa3O09000 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ncoa3O09000 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ncoa3O09000 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ncoa3O09000 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ncoa3O09000 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ncoa3O09000 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ncoa3O09000 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ncoa3O09000 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ncoa3O09000 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ncoa3O09000 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ncoa3O09000 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ncoa3O09000 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ncoa3O09000 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms