Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
U90926O08546 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
U90926O08546 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
U90926O08546 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
U90926O08546 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
U90926O08546 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
U90926O08546 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
U90926O08546 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
U90926O08546 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
U90926O08546 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
U90926O08546 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
U90926O08546 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
U90926O08546 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
U90926O08546 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
U90926O08546 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
U90926O08546 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
U90926O08546 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
U90926O08546 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
U90926O08546 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
U90926O08546 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
U90926O08546 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
U90926O08546 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
U90926O08546 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
U90926O08546 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
U90926O08546 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
U90926O08546 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
U90926O08546 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
U90926O08546 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
U90926O08546 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
U90926O08546 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
U90926O08546 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
U90926O08546 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
U90926O08546 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
U90926O08546 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
U90926O08546 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
U90926O08546 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
U90926O08546 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
U90926O08546 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
U90926O08546 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
U90926O08546 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
U90926O08546 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
U90926O08546 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
U90926O08546 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
U90926O08546 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
U90926O08546 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
U90926O08546 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
U90926O08546 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
U90926O08546 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
U90926O08546 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
U90926O08546 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
U90926O08546 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
U90926O08546 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
U90926O08546 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
U90926O08546 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
U90926O08546 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
U90926O08546 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
U90926O08546 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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U90926O08546 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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U90926O08546 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
U90926O08546 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
U90926O08546 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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U90926O08546 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
U90926O08546 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
U90926O08546 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
U90926O08546 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
U90926O08546 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
U90926O08546 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
U90926O08546 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
U90926O08546 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
U90926O08546 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
U90926O08546 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
U90926O08546 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
U90926O08546 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
U90926O08546 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
U90926O08546 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
U90926O08546 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
U90926O08546 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
U90926O08546 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
U90926O08546 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
U90926O08546 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
U90926O08546 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
U90926O08546 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
U90926O08546 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
U90926O08546 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
U90926O08546 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
U90926O08546 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
U90926O08546 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
U90926O08546 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
U90926O08546 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
U90926O08546 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
U90926O08546 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
U90926O08546 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
U90926O08546 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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