Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efna5O08543 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Efna5O08543 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efna5O08543 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efna5O08543 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efna5O08543 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efna5O08543 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efna5O08543 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efna5O08543 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Efna5O08543 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms