Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ascl4M0QW46 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ascl4M0QW46 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms