Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20939L7N243 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20939L7N243 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms