Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3542K7N6U2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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