Protein–RNA interactions for Protein: J3QPV3

Gm21883, Predicted gene, 21883, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21883J3QPV3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm21883J3QPV3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm21883J3QPV3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm21883J3QPV3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm21883J3QPV3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm21883J3QPV3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm21883J3QPV3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm21883J3QPV3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm21883J3QPV3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm21883J3QPV3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm21883J3QPV3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21883J3QPV3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21883J3QPV3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms