Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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