Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Cldn34c2J3QNM1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Cldn34c2J3QNM1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cldn34c2J3QNM1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cldn34c2J3QNM1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c2J3QNM1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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