Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21972J3QN38 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21972J3QN38 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms