Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20918J3QN17 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms