Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lipo1J3QME6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lipo1J3QME6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms