Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccdc179J3QM76 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms