Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3727J3QM54 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms