Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930544D05RikJ3QK56 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930544D05RikJ3QK56 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms