Protein–RNA interactions for Protein: I6L890

Casp16-ps, Caspase 16, apoptosis-related cysteine peptidase, pseudogene, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp16-psI6L890 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casp16-psI6L890 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casp16-psI6L890 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casp16-psI6L890 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casp16-psI6L890 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casp16-psI6L890 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Casp16-psI6L890 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casp16-psI6L890 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casp16-psI6L890 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casp16-psI6L890 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casp16-psI6L890 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casp16-psI6L890 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casp16-psI6L890 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Casp16-psI6L890 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casp16-psI6L890 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casp16-psI6L890 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casp16-psI6L890 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casp16-psI6L890 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Casp16-psI6L890 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp16-psI6L890 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms