Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AK157302I3ITR1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AK157302I3ITR1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AK157302I3ITR1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms