Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp408H7BX78 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp408H7BX78 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms