Protein–RNA interactions for Protein: H3BKF4

Gm20708, Predicted gene 20708, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20708H3BKF4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20708H3BKF4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20708H3BKF4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms