Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17lcG5E8I7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms