Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r34G3XA52 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r34G3XA52 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms