Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r58G3X9U3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms