Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf148G3X9R7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf148G3X9R7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms