Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zkscan2G3X952 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zkscan2G3X952 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms