Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc9a3G3X939 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms