Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nkx1-1G3UXB3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx1-1G3UXB3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms