Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r76F8VQ63 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r76F8VQ63 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms