Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Colca2F8VPY8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Colca2F8VPY8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms