Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

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Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp9yF8VPU6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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