Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
H2-M1F7CXU4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M1F7CXU4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms