Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
D430041D05RikF6ZGR6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
D430041D05RikF6ZGR6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
D430041D05RikF6ZGR6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms