Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17555F6U8B9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17555F6U8B9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17555F6U8B9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17555F6U8B9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17555F6U8B9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17555F6U8B9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17555F6U8B9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17555F6U8B9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17555F6U8B9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17555F6U8B9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17555F6U8B9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17555F6U8B9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17555F6U8B9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17555F6U8B9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17555F6U8B9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17555F6U8B9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17555F6U8B9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17555F6U8B9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17555F6U8B9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17555F6U8B9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17555F6U8B9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17555F6U8B9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17555F6U8B9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17555F6U8B9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17555F6U8B9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17555F6U8B9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm17555F6U8B9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm17555F6U8B9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms