Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmod3E9QA62 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms