Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cald1E9QA15 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cald1E9QA15 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms