Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9N3

Vmn1r152, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r152E9Q9N3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r152E9Q9N3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r152E9Q9N3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r152E9Q9N3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r152E9Q9N3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r152E9Q9N3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r152E9Q9N3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r152E9Q9N3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r152E9Q9N3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r152E9Q9N3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r152E9Q9N3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r152E9Q9N3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r152E9Q9N3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r152E9Q9N3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r152E9Q9N3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r152E9Q9N3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r152E9Q9N3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r152E9Q9N3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r152E9Q9N3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r152E9Q9N3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r152E9Q9N3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r152E9Q9N3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r152E9Q9N3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r152E9Q9N3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r152E9Q9N3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms