Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

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Length 693 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrdnE9Q9K5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TrdnE9Q9K5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms