Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ankrd35E9Q9D8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd35E9Q9D8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms