Protein–RNA interactions for Protein: E9Q956

Mcmdc2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcmdc2E9Q956 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcmdc2E9Q956 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms