Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp31E9Q6Y8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms