Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
BC005561E9Q5E2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC29■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC29■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BC005561E9Q5E2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BC005561E9Q5E2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms