Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc71lE9Q4T4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc71lE9Q4T4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc71lE9Q4T4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc71lE9Q4T4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc71lE9Q4T4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc71lE9Q4T4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ccdc71lE9Q4T4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ccdc71lE9Q4T4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc71lE9Q4T4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc71lE9Q4T4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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