Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tarbp1E9Q368 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tarbp1E9Q368 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tarbp1E9Q368 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms